《基因组数据运算学在医药发展的应用》讲座通知
发布者:系统管理员
发布时间:2013-06-19
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肺癌是全世界癌症致死率中的前几名,只有具EGFR特定突变的肺癌病人对于肺癌药物艾瑞莎有较好的反应,然而这些病人在药物治疗不久后几乎都会产生抗药性。由于开发新药需极大成本,因此从老药新用着手来发展肺癌药物是非常适合的策略。我们假设一药物可逆转肺癌相关的基因之表现图谱,推测其可能具有调控肺癌中异常表现之讯息传递的潜力。越来越多的证据支持癌干细胞与肿瘤的发生、复发和抗药性有密不可分的关系。
我们利用已公开的胚胎干细胞和癌干细胞相关的基因图谱与以连接网络数据库(Connectivity Map,CMap)进行比对,筛选出数个潜在药物,至少可以部分扭转干细胞的基因表达图谱。其中几个为抗精神病药物,包括trifluoperazine。trifluoperazine加上gefitinib或cisplatin的复方可有效克服肺癌干细胞之耐药性。此外在肺癌转移及原位肺癌干细胞动物模型中trifluoperazine抑制了肿瘤的生长和增强gefitinib的抑制活性。利用Connectivity Map平台配合实验验证我们重新赋与抗精神病药物trifluoperazine新的功效,此一结果我们已发表在Am J RespirCrit Care Med. 2012 (IF=11)。此外,我们利用一项革命性的技术--L1000来测量基因的表现,透过L1000技术仅须检测约一千个目标基因的表现量,进一步利用生物信息学的统计演算模式,将这一千个基因表现量转换成其他两万个基因(全基因体基因)的表现结果。L1000已经过严格的验证,自2010年起就在美国Broad Institute使用,迄今已产出了百万笔以上的数据,并建立了庞大的数据库,经过这样的使用经验,不论是单一基因表现量的测试还是全基因的表现图谱,都是有相当程度的准确性的。
总而言之,我们以基因表现图谱及CMap将基因、药物及疾病作连结,不仅为肺癌药物建立快速又系统化的筛选方法,也是发展个人化医疗的快捷方式。
演讲人:黄奇英教授 国立阳明大学生物药学研究所教授兼所长
时间:2013年6月21日星期五上午10:00
地点:庄瑾楼402报告厅
主办单位:厦门大学药学院
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